Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms