Protein–RNA interactions for Protein: Q5MIZ7

PPP4R3B, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R3BQ5MIZ7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R3BQ5MIZ7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms