Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms