Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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