Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC23Q53EV4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms