Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXF1

FAM74A3, Putative protein FAM74A3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A3Q4VXF1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM74A3Q4VXF1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms