Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF1Q3BBV0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms