Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFAF6Q330K2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF6Q330K2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms