Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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PTPRNQ16849 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PTPRNQ16849 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PTPRNQ16849 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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