Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNGA3Q16281 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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