Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CDSNQ15517 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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