Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PUM3Q15397 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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