Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms