Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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