Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms