Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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