Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENBP1Q13228 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms