Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRDNQ13061 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRDNQ13061 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
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