Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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ECH1Q13011 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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