Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms