Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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