Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIAQ12857 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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