Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYCNQ0VAF6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms