Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf54Q08AI8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf54Q08AI8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms