Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms