Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms