Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD164Q04900 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD164Q04900 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms