Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCNT1Q02742 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms