Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 AC084759.2-202ENST00000557976 1053 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 BX255923.1-201ENST00000613309 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 COA4-201ENST00000355693 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms