Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDR2Q01850 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms