Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB1P62873 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GNB1P62873 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms