Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms