Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms