Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP9P55211 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP9P55211 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP9P55211 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms