Protein–RNA interactions for Protein: P55083

MFAP4, Microfibril-associated glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP4P55083 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MFAP4P55083 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MFAP4P55083 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MFAP4P55083 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MFAP4P55083 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms