Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF143P52747 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF143P52747 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms