Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC3P51654 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC3P51654 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC3P51654 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPC3P51654 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPC3P51654 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC3P51654 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC3P51654 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC3P51654 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC3P51654 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC3P51654 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC3P51654 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC3P51654 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC3P51654 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC3P51654 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC3P51654 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC3P51654 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC3P51654 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC3P51654 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms