Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETV1P50549 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETV1P50549 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETV1P50549 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETV1P50549 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETV1P50549 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETV1P50549 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETV1P50549 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETV1P50549 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETV1P50549 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETV1P50549 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETV1P50549 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETV1P50549 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETV1P50549 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETV1P50549 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETV1P50549 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETV1P50549 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETV1P50549 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETV1P50549 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ETV1P50549 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ETV1P50549 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ETV1P50549 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms