Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms