Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTAP49354 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTAP49354 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FNTAP49354 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FNTAP49354 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms