Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHKA1P46020 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms