Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CEACAM3P40198 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CEACAM3P40198 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CEACAM3P40198 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CEACAM3P40198 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CEACAM3P40198 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CEACAM3P40198 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEACAM3P40198 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEACAM3P40198 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEACAM3P40198 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CEACAM3P40198 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms