Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAL1P37235 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAL1P37235 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAL1P37235 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAL1P37235 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAL1P37235 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAL1P37235 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPCAL1P37235 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAL1P37235 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms