Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB2P35606 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COPB2P35606 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COPB2P35606 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB2P35606 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB2P35606 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms