Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRNA5P30532 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA5P30532 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms