Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms