Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT1P21579 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT1P21579 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT1P21579 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT1P21579 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT1P21579 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT1P21579 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT1P21579 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT1P21579 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT1P21579 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT1P21579 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT1P21579 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT1P21579 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms