Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD247P20963 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD247P20963 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD247P20963 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD247P20963 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms