Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms