Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms